Le Miami Cancer Institute offre des soins de précision grâce à l’informatique de santé

L’essor de la médecine de précision permet aux oncologues et aux patients atteints de cancer d’accéder à de vastes quantités d’informations essentielles qui peuvent être exploitées pour établir un profil complet de la maladie d’un patient et déterminer le meilleur traitement.

Le défi : donner un sens à ces données.

Après tout, le génome humain compte plus de 20 000 gènes. Et chaque patient présente des variations et des prédispositions génétiques uniques, ce qui signifie que deux personnes atteintes du même cancer peuvent avoir des besoins très différents.

Un nouvel outil aide le Miami Cancer Institute à clarifier ce processus complexe. Au début de l’année, le centre anticancéreux du sud de la Floride a commencé à utiliser IntelliSpace Precision Medicine Genomics, un système qui associe le séquençage de l’ADN de nouvelle génération à des algorithmes d’apprentissage profond.

La clinique utilise des montagnes de données précises sur les mutations génétiques, les médicaments qui pourraient les cibler et les critères d’inscription aux essais cliniques pertinents pour élaborer un plan d’attaque personnalisé.

Mis au point par Philips avec l’aide de scientifiques tiers, cet outil collaboratif permet d’accomplir quelque chose qui dépasse de loin les capacités de la plupart des centres anticancéreux, explique Jeff Boyd, directeur de la recherche translationnelle et de la médecine génomique de l’institut de Miami.

« La capacité d’interpréter des téraoctets de données binaires provenant de la tumeur d’un patient et de les transformer en un rapport de pathologie moléculaire convivial pour l’oncologue nécessite une infrastructure technologique très solide, avec beaucoup de personnes et d’ordinateurs », explique M. Boyd. « Cette technologie peut être exploitée pour faire des choses vraiment extraordinaires ».

Comment la médecine de précision utilise-t-elle les données des patients atteints de cancer ?

Pour commencer, l’équipe de Miami obtient une biopsie de la tumeur et effectue le séquençage de l’ADN dans son laboratoire de génomique.

Les données de l’échantillon – qui couvrent des centaines de gènes et de types de variantes associés aux tumeurs solides courantes et permettent d’évaluer plusieurs biomarqueurs – sont introduites dans le dossier médical électronique du patient. Ce dossier est ensuite transmis via la plateforme numérique HealthSuite de Philips, basée sur le cloud, à N-of-One, une société tierce d’aide à la décision moléculaire.

Les experts de cette société, explique M. Boyd, « effectuent des analyses bioinformatiques qui seraient ininterprétables pour un oncologue ». La société « nettoie les données et fournit un rapport convivial de très bonne qualité » qui est envoyé par voie électronique au Miami Cancer Institute. Le processus prend environ 10 jours du début à la fin.

La plate-forme Philips offre des fonctions de protection de la vie privée (les informations personnelles des patients sont masquées) et des contrôles qui suivent les meilleures pratiques et sont conformes aux réglementations applicables, telles que l’HIPAA. Elle intègre également des contrôles de sauvegarde, de récupération et de cryptage, ainsi que des mécanismes d’authentification et d’autorisation sécurisés.

Une plateforme en nuage relie les données sur le cancer

Chaque patient reçoit finalement un rapport basé sur l’analyse des données. Les champs identifient les gènes et les mutations critiques, les médicaments approuvés par la FDA qui ciblent ces tumeurs et ces mutations spécifiques, les médicaments qui correspondent à une mutation mais pour un autre type de tumeur (ce que l’on appelle « l’utilisation non indiquée sur l’étiquette »), et les essais cliniques pertinents pouvant être recherchés en fonction de la localisation du patient.

Grâce à la technologie de Philips, « nous pouvons identifier les codes postaux qui s’intéressent à une mutation génétique spécifique avec des médicaments spécifiques qui sortent du pipeline et sont utilisés dans le cadre d’un essai clinique dans une institution ou une autre », explique M. Boyd.

L’objectif ultime ? Gagner du temps et de l’argent, et en déduire les traitements médicaux les mieux adaptés pour cibler une tumeur particulière – une exécution stratégique que Boyd décrit comme « une clé dans une serrure ou une main dans un gant ».

Pourtant, l’approche ne convient pas à tous les cas. Les médecins recommandent l’utilisation de la technologie IntelliSpace en fonction du type de cancer du patient et de la viabilité des options existantes, explique M. Boyd, en précisant que les variantes plus difficiles à traiter, comme le cancer du poumon et du pancréas, sont des candidats de choix.